Полномочия и функции Учредителя от имени Ульяновской области осуществляет Министерство образования и науки Ульяновской области.
Управление ОГБУ ДО «ДООЦ Юность» в соответствии с действующим законодательством Российской Федерации строится на основе сочетания принципов единоначалия и коллегиальности.
Коллегиальные органы управления: Общее собрание трудового коллектива, Совет Центра, Педагогический совет, Методический совет.
Единоличным исполнительным органом Центра является директор, который осуществляет текущее руководство деятельностью Центра.
Центр самостоятелен в формировании своей структуры.
Центр в своей структуре имеет различные структурные подразделения, обеспечивающие осуществление образовательной деятельности (учебные кабинеты, спальный корпус для проживания обучающихся, спортивный зал, дискозал), а также иные структурные подразделения, связанные с обеспечением образовательной деятельности (столовая, финансовый и хозяйственный отделы, хозяйственные помещения, медицинский пункт, изолятор).
Структурные подразделения Центра не являются юридическими лицами и действуют на основании Устава Центра и положения о соответствующем структурном подразделении.